發布:2022-09-18 10:59:29 關注:23015次
記者從天津大學獲悉,該校合成生物學團隊創新dna存儲算法,將十幅精選敦煌壁畫存入dna中,通過加速老化實驗驗證壁畫信息在實驗室常溫下可保存千年,在9.4℃下可保存兩萬年。該算法支持dna分子成為世界上最可靠的數據存儲介質之一,可以讓面臨老化破損危機的人類文化遺產信息保存千年萬年。
該成果近日發表于《自然·通訊》上。
dna存儲的敦煌壁畫
從結繩記事、倉頡造字到磁帶、硬盤等現代磁光電存儲技術,人類文明的發展與存儲技術密切相關。隨著科學技術的進步,數據存儲方式不斷迭代創新。中國科學院院士、天津大學元英進教授帶領團隊一直致力于下一代存儲技術——dna存儲。“據國際數據公司估計,到2025年全球數據總量將達到驚人的175zb(1zb≈10的21次方字節)。全世界都在建數據中心,數據中心的能耗是驚人的。dna存儲由于其高存儲密度與低能耗處理等特點,被視為一種極具潛力的存儲技術,成為應對數據存儲增長挑戰的新機遇?!痹⑦M院士介紹說。
2021年8月元英進教授團隊取得dna存儲的重大突破,從頭編碼設計合成了一條長度為254886堿基對、專用于數據存儲的酵母人工染色體,將兩張經典圖片和一段視頻存儲于人造染色體中,利用酵母繁殖實現了數據穩定復制,并用納米孔測序器件實現了數據快速讀出與無錯恢復。
dna存儲技術概念圖
dna存儲高效低耗,但作為一種鏈式生物大分子,在體外常溫保存時會面臨dna斷裂降解等風險,嚴重影響信息存儲的長期可靠性,是亟待解決的關鍵科學問題。對此,元英進團隊設計了基于德布萊英圖理論的序列重建算法來解決dna斷裂等問題。該算法結合貪婪路徑搜索和循環冗余校驗碼來實現斷裂dna片段的高效從頭組裝,從原理上支持了dna存儲的長期可靠性。
結合該序列重建算法(內碼)與噴泉碼算法(外碼),團隊設計編碼了6.8mb敦煌壁畫,合成了承載圖片信息的dna片段21萬條。為數據的長期可靠性,團隊制備了一個沒有任何特殊保護的dna水溶液樣本,并在70℃下加速樣本斷裂、降解長達十周。處理后的dna片段80%以上都發生了斷裂錯誤,依靠設計的序列重建算法依然可以準確組裝并解碼96.4%以上的片段,再通過噴泉碼解決少量片段丟失的問題,原始的敦煌壁畫圖片依然能夠完美恢復。根據理論推算,這種程度的高溫破壞相當于實驗室常溫25℃一千年或者9.4℃長達兩萬年的自然保存。
這是繼基于人工合成染色體的酵母體內信息存儲模式取得突破后,天津大學合成生物學團隊在dna信息體外存儲模式上取得的又一重要突破。(張建新、趙暉)
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